Le formatage EXT3 appartient à Linux, qui est le système de gestion du Neli. La fragmentation est consubstantielle au NTFS ou Fat32 qui écrit sur le DD par "morceau" là ou il trouve de la place.
Le Fat32 ne peut pas gérer des fichiers plus gros que 2Go. Le système EXT3 n'a pas ce type de limitation.
On trouve des drivers qui permettent de gérer des DD formatés en EXT3 avec les différents Windows.

